Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGCXP38435 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGCXP38435 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGCXP38435 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGCXP38435 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGCXP38435 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGCXP38435 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGCXP38435 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGCXP38435 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGCXP38435 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGCXP38435 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms