Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms