Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms