Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT2P35908 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT2P35908 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms