Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN1P35523 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN1P35523 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms