Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNB1P35222 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms