Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASTP20810 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASTP20810 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASTP20810 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms