Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms