Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms