Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF3P18847 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF3P18847 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATF3P18847 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATF3P18847 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF3P18847 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF3P18847 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF3P18847 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms