Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB6P18564 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms