Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms