Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCP1P17987 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCP1P17987 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms