Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms