Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms