Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms