Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA1P17302 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA1P17302 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA1P17302 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA1P17302 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA1P17302 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA1P17302 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA1P17302 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA1P17302 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA1P17302 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA1P17302 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA1P17302 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA1P17302 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA1P17302 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA1P17302 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA1P17302 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA1P17302 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms