Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRAFP15056 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRAFP15056 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRAFP15056 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms