Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA1P14867 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms