Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms