Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIP12755 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIP12755 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIP12755 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIP12755 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIP12755 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms