Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms