Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGA3P0DJD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms