Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTAP09496 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTAP09496 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTAP09496 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTAP09496 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTAP09496 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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