Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms