Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms