Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms