Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3DP05423 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3DP05423 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3DP05423 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3DP05423 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3DP05423 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3DP05423 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3DP05423 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms