Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGAP02671 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FGAP02671 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FGAP02671 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGAP02671 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms