Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN9O95484 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN9O95484 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CLDN9O95484 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN9O95484 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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