Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLIT2O94813 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLIT2O94813 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms