Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOX1O75936 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms