Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMUO75648 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms