Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX3O75364 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms