Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBNO60934 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBNO60934 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBNO60934 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBNO60934 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NBNO60934 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBNO60934 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NBNO60934 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBNO60934 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms