Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms