Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms