Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATCO43716 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATCO43716 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATCO43716 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATCO43716 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms