Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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