Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1L1O43166 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1L1O43166 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1L1O43166 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1L1O43166 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1L1O43166 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1L1O43166 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms