Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms