Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARPC5O15511 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARPC5O15511 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARPC5O15511 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARPC5O15511 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC5O15511 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms