Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCAO15360 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCAO15360 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCAO15360 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCAO15360 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCAO15360 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms