Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNPHO15079 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms