Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms