Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms