Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms