Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms