Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM223A0PJW6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms