Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXQ1Q9C009 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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